Manipulación de Datos H5 en Python

Tutorial y artículo sobre la manipulación de datos H5 en Python

En este tutorial y artículo, aprenderemos cómo manipular datos H5 en Python. Los archivos H5 son un formato de archivo de datos binario que se utiliza para almacenar grandes cantidades de datos estructurados. Son una buena opción para almacenar datos científicos, como imágenes, audio y datos de sensores.

Introducción a los archivos H5

Los archivos H5 se componen de dos partes principales: un encabezado y un cuerpo. El encabezado contiene información sobre el formato del archivo, como el tipo de datos almacenados y el tamaño de los datos. El cuerpo contiene los datos reales.

Los archivos H5 utilizan una estructura de datos jerárquica para almacenar datos. Esto significa que los datos se pueden organizar en grupos, datasets y atributos. Los grupos son contenedores para datasets y atributos. Los datasets son conjuntos de datos de un solo tipo de datos. Los atributos son pares de nombre-valor que se pueden asociar a grupos, datasets o atributos.

Manipulación de datos H5 en Python

Para manipular datos H5 en Python, podemos utilizar la biblioteca h5py. Esta biblioteca proporciona una API de alto nivel para leer, escribir y manipular datos H5.

Lectura de datos H5

Para leer datos H5 en Python, podemos utilizar la función open() de la biblioteca h5py. Esta función devuelve un objeto File, que representa el archivo H5 abierto.

Python
import h5py

# Abre el archivo H5
file = h5py.File("data.h5", "r")

# Lee el dataset "data"
data = file["data"]

# Imprime el contenido del dataset
print(data)

Este código abrirá el archivo H5 data.h5 en modo de lectura (r). A continuación, leerá el dataset data del archivo y lo imprimirá en la consola.

Escritura de datos H5

Para escribir datos H5 en Python, podemos utilizar la función create_dataset() de la biblioteca h5py. Esta función crea un nuevo dataset en un archivo H5.

Python
import h5py

# Abre el archivo H5
file = h5py.File("data.h5", "w")

# Crea un nuevo dataset
data = file.create_dataset("data", (100, 100), dtype=int)

# Escribe datos en el dataset
data[:] = np.random.randint(0, 255, (100, 100))

# Cierra el archivo H5
file.close()

Este código abrirá el archivo H5 data.h5 en modo de escritura (w). A continuación, creará un nuevo dataset llamado data con 100 filas y 100 columnas. El tipo de datos del dataset es int. Por último, escribirá datos aleatorios en el dataset.

Manipulación de atributos H5

Para manipular atributos H5 en Python, podemos utilizar la función attrs() de la biblioteca h5py. Esta función devuelve un objeto Group que representa los atributos del objeto especificado.

Python
import h5py

# Abre el archivo H5
file = h5py.File("data.h5", "r")

# Atributos del dataset "data"
data_attrs = file["data"].attrs

# Añade un atributo al dataset
data_attrs["name"] = "My data"

# Actualiza un atributo del dataset
data_attrs["size"] = 10000

# Elimina un atributo del dataset
del data_attrs["name"]

# Cierra el archivo H5
file.close()

Este código abrirá el archivo H5 data.h5 en modo de lectura (r). A continuación, accederá a los atributos del dataset data. A continuación, añadirá un atributo name al dataset con el valor «My data». A continuación, actualizará el atributo size del dataset con el valor 10000. Por último, eliminará el atributo name del dataset.

Conclusión

En este tutorial y artículo, hemos aprendido cómo manipular datos H5 en Python. Hemos aprendido cómo leer, escribir y manipular datasets y atributos H5.